АПФ: кое-что о пространственной структуре
В настоящее время пространственная структура АПФ неизвестна, но на основании косвенных данных можно предполагать в ней тесный контакт между доменами. В частности, N-домен тормозит переход мембранного фермента в растворимую форму [ Beldent ea 1993 , Beldent ea 1995 ]. В нормальных условиях секретазой за один час освобождается не менее 2% от имеющегося на мембране фермента, т.е. существенно большая часть АПФ остается на клетке. Мутантный фермент, не содержащий N-домена, освобождался в 10 раз быстрее, чем полноразмерный фермент, и при этом гидролизовалась пептидная связь (Arg1227-Val1228), находящаяся ближе к трансмембранному участку, чем в полноразмерном ферменте (Arg1137-Leu1138). На основании полученных данных предполагается, что N-домен расположен вблизи стебелькового участка (область между концом глобулярной части С-домена и гидрофобным трансмембранным участком) молекулы. Взаимодействуя со стебельковой зоной АПФ и/или самой секретазой, он может быть "конформационным ингибитором" реакции ограниченного протеолиза при освобождении мембраносвязанного АПФ. Кроме того, возможно, что активные центры обоих доменов находятся на близком расстоянии, так как моноклональные антитела к N-домену, тормозившие активность мутантного N-домена, но не взаимодействовавшие с С-доменом [ Danilov ea 1994 , Williams ea 1992 ], тормозили активность обоих доменов нативного полноразмерного фермента и активность С-домена в мутантном полноразмерном АПФ с неактивным N-доменом. Хотя при этом нельзя исключить возможность изменения конформации молекулы в результате взаимодействия с антителом, что может мешать последующему сязыванию субстрата с обоими активными центрами или затруднять или предотвращать доступ субстрата к ним.
