Ангиогенин: структура пространственная
Структура молекулы АНГ человека представлена на рис. 2 . Остов молекулы состоит из бета-структуры с парой антипараллельных лент ВЗ-В4 (аминокислотные остатки 69-84) и В5-В6 (остатки 93-108). Две дополнительные ленты В1 (остатки 41-47) и В7 (остатки 111-116) сбоку от центральных лент дополняют основную складчатую структуру. В основании молекулы находится короткая добавочная лента В2 (остатки 62-65). Спираль H-I (остатки 3-14 на N-конце) приближена к короткой З10- спирали (остатки 117-121 на С-конце), которая отсутствует в РНКазе. Спирали Н-2 (остатки 22-33) и Н-3 (остатки 49-58) ориентированы по отношению к бета-складкам под углом около 70*. Эти спирали связаны между собой бета-лентой В1. Остальные остатки образуют петлевые структуры. Вставки, делеции и все неконсервативные замещения находятся в петлевых структурах и на N- и С-концах.
РНКаза А имеет три дисульфидные связи, структурно эквивалентные копиям в АНГ, а также - четвертую, между остатками 65-72; в АНГ эту позицию занимает боковая цепь Leu- 69. Наибольшие различия между двумя структурами отмечаются в сегментах 1-4, 17-23 (петля 1), 36-38 (петля 2), 58-75 (петли 4 и 5, ленты В2 и ВЗ), 85-93 (петля 7), 109-111 (петля 9) и 117- 123 [ Acharya K.R. et al., 1994 ]. Активный центр РНКазы состоит из сайтов P1, B1, В2 и нескольких дополнительных сайтов. Сайт P1 отвечает за расщепление фосфодиэфирных связей, сайт B1 - за связывание пиримидинов, сайт В2 - за связывание пуринов.
Дополнительные сайты связывают периферические основания и фосфаты. Сайт Pi включает в себя аминокислотные остатки His-12, Lys-41, His-119 и Gln-11; сайт B1 - Thr-45 и Ser-123; сайт В2 - Asn-67, Gln-69, Asn-71 и Glu-111 [ Richards P.M., Wyckoff H.W., 1971 , Wodak S.Y. et al., 1977 , Brunger A.T. et al., 1985 ]. В структуре АНГ человека сайты P1, B1, а также часть сайта В2 сохранены в виде остатков His-13, Lys-40, His-114, Gin-12, Thr-44, Ser-118 и Glu-108 [ Acharya K.R. et al., 1994 ].
