Анкирин R и его изоформы
В эритроцитах человека анкирин R всегда представлен несколькими формами с различными молекулярными массами.
Основная по количеству форма анкирина - белок полосы 2,1 . Молекулярная масса этого белка, определенная методом электрофореза в ПААГ в присутствии Ds-Na, составляет 210 кДа, реально же она равна 206 кДа (1880 аминокислотных остатков).
Другие формы анкирина в эритроцитах человека представлены белками, имеющими электро-форетическую подвижность, соответствующую молекулярным массам 195 кДа ( белок полосы 2,2 ), 175 кДа ( белок полосы 2,3 ) и 145 кДа ( белок полосы 2,6 ) [ Peters L. and Lux S.E., 1993 ]. Реальная масса белков полос 2,2 и 2,3 несколько меньше и составляет 186 и 170 кДа соответственно. В эритроцитах других животных набор белков семейства анкиринов может быть иным (например, в эритроцитах крысы отсутствует белок полосы 2,2) [ Bennett V., 1992 ].
Анкирины с электрофоретической подвижностью, соответствующей молекулярным массам 210, 195, 175 и 145 кДа, легко выявляются при стандартном окрашивании белков с использованием красителей (например, Кумасси бриллиантового голубого).
Однако при иммуноблоттинге с применением антител к анкирину R выявляется еще до восьми дополнительных белковых полос, соответствующих представленным в меньшем количестве анкиринам, с молекулярными массами от 320 до 117 кДа или даже до 90 кДа [ Peters L. and Lux S.E., 1993 ]. Большинство из этих изоформ образуется, по-видимому, благодаря альтернативному сплайсингу пре-мРНК анкирина [ Hall T.G. and Bennett V., 1987 ].
Фрагмент анкирина с массой 175 кДа in vitro появляется в результате ограниченного протеолиза полной молекулы анкирина кальпаином [ Hall T.G. and Bennett V., 1987 , Davis L. et al., 1989 ], но происходит ли то же самое в клетке, пока неизвестно.
