Апо E: структура

АпоЕ человека представляет собой полипептид из 299 аминокислотных остатков, молекулярная масса которого составляет 34200 Да [ Rail ea 1982 ].

АпоЕ плазмы крови крыс содержит 293 аминокислотных остатка, он на 71% гомологичен апоЕ человека [ Fung ea 1986 , Hussain ea 1988 ].

Используя различные структурные фрагменты апоЕ и моноклональные антитела, препятствующие взаимодействию белка с рецептором, Вэйсгребер с соавт. [ Weisgraher ea 1985 ] пришли к выводу, что домен рецепторного связывания АпоЕ охватывает центральный участок молекулы.

Позднее с помощью синтетических фрагментов апоЕ удалось показать, что домен рецепторного связывания с В, Е-рецептором занимает участок 141-155. Замещение лизина в положении 143 аланином, лейцина в положении 144 пролином или аргинина в положении 150 аланином влияет на активность рецепторсвязывающего домена, подтверждая тот факт, что в него вовлечен центральный участок молекулы [ Dyer ea 1988 , Dyer ea 1991 ].

При анализе мРНК выяснена последовательность сигнального пептида , с которого начинается биосинтез апоЕ. Он включает в себя 18 аминокислотных остатков. Этот сигнальный пептид затем котрансляционно удаляется.

В структуре апоЕ выделяются идентичные повторы по 22 аминокислотных остатка. Эти области играют роль липидсвязывающих доменов . В целом структура апоЕ характеризуется высокой степенью упорядоченности, обусловленной, в первую очередь, наличием альфа-спиральной формы [ Jonas ea 1993 ].