ДНК: связывание с ядерным матриксом, механизм
Был предложен предположительный механизм связывания молекулы ДНК с ядерным матриксом , при котором важную роль играют АТ-богатые области MARs ( Gasser S.M. and Laemmli U.K., 1987 ), и связывание предположительно происходит по малой бороздке молекулы ДНК ( Liliane A. ea, 1992 ).
Отмечено, что в тех случаях, когда мутации затрагивают АТ-богатые последовательности (и повышают тем самым стабильность двойной спирали), аффинность MARs к ядерному матриксу снижается ( Liliane A. ea, 1992 ). Вероятно, чередование легко плавящихся А-Т-богатых участков ДНК и скрученных, более стабильных участков, создает определенную вторичную структуру молекулы, предположительно участвующую в узнавании матриксом матрикс-связывающих участков ДНК .
В экспериментах по гибридизации и картированию последовательностей, расположенных в пределах 800 т. п. о. Х хромосомы дрозофилы было установлено, что SARs в своем большинстве не являются членами семейства умеренных повторов ( Surdej P. ea, 1991 ). Однако, умеренные повторы достаточно часто локализованы очень близко к MARs. Сообщено так же, что 86 MARs не гибридизовались друг с другом с высокой частотой, а с низкой частотой образовывали сеть гомологий. Предполагается два возможных объяснения близости повторов и MARs. Первое (если принимать то, что умеренные повторы являются мобильными элементами) - встраивание мобильного элемента в ДНК должно происходить близко к месту взаимодействия ее с нуклеоскелетом. Вторая возможность - встраивание мобильной поледовательности может происходить в любом месте генома, но только у основания петель данные последовательности сохраняются, так как меньше влияют на функциональное состояние генов.
Результаты гибридизации приводят нас к парадоксу. MARs существуют у большинства эукариотических организмов, но не являются очень консервативными по структуре последовательностями ( Surdej P. ea, 1991 ).
