Актин глобулярный: Структура пространственная: Домены
По данным рентгеноструктурного анализа кристаллов G- актина в комплексе с ДНКазой I, приведших к выявлению трехмерной структуры мономера с разрешением 2,8 ангстрем, молекула актина состоит из двух доменов, общий размер которых составляет 5,5*5,5*3,5 нм ( рис.2.12 ). Исторически домены называются большим и малым, хотя их размеры практически одинаковы. Как N-конец, так и С-конец полипептидной цепи находятся в малом домене . Каждый из доменов состоит из двух субдоменов. По определению, субдомен 1 (остатки 1 - 32, 70 - 144 и 338 - 372) и субдомен 2 (остатки 33 - 69) составляют малый домен, большой домен состоит из субдомена 3 (остатки 145 - 180 и 270 - 337) и субдомена 4 (остатки 181 - 269). Домены разделены глубокой щелью.
Каждый мономер актина содержит одну молекулу прочно связанной АТР, которая может свободно обмениваться с нуклеотидом в растворе и замещаться другими нуклеотидами. В растворах с низкой ионной силой сродсво АТР к актину на несколько порядков превышает сродство АДР к актину, при физиологических условиях это различие значительно уменьшается. Пространственные структуры мономеров актина, содержащие АТР и АДР, сходны. Нуклеотид расположен в щели между доменами. При этом адениновое основание входит в карман, образованный Lys-213, Glu-214, Thr-303, Met- 305, Tyr-306 и Lys-336. Гидроксильные группы рибозного кольца и фосфатные группы нуклеотида участвуют в образовании водородных связей с гидроксильными и амидными группами аминокислотных остатков субдоменов 1 и 3, расположенных в области щели.
