Функциональная роль "bent" и "antibent" ДНК
Какова функциональная роль изогнутого ("bent") A+T богатого домена и A+T богатого домена, относительно прямого ("antibent")? Вспомним, что изогнутый участок, тем более в комплексе с некоторым количеством единиц инициаторного белка, который часто его дополнительно изгибает, может образовывать структуру типа ядра, первоначально наблюдаемую электронно-микроскопически ( Funnell et al, 1987 ; Fuller & Kornberg, 1983 ), так называемую ДНК-белковый "core", и приближать этот "core" к прямым повторам, в области которых и расположен участок первичного расплавления. Он в ряде случаев может отстоять на значительное расстояние, например, как в плазмиде R6K, на 200 нп от сайта связывания. Отмечается, что в самом "core"'е происходит кооперативное взаимодействие инициаторных белков и этот ансамбль служит прежде всего для выплавления первичного участка. Отмечено, что состояние этого участка является температурно нестабильным. Для повышения его стабильности используются дополнительные белки и факторы, в совокупности создающие "prepriming" (прединициирующий) комплекс, который уже более температурно стабилен.
