Филогения класса Kinorhyncha
Происхождение класса Kinorhyncha не вполне ясно; сначала их считали членистоногими с атрофировавшимися конечностями, но наличие протонефридиев (у членистоногих их никогда не бывает) опровергло это предположение.
Общий план строения киноринх свидетельствует о принадлежности их к первичнополостным червям. По кутикуляризации покровов, росту с помощью линек, строению глотки они напоминают нематод , но имеют некоторое сходство с брюхоресничными (наличие протонефридиев). Однако этого недостаточно, чтобы сближать класс Kinorhyncha с какой-либо конкретной группой типа Nemathelminthes.
Некоторые исследователи отмечают, кроме того, известное сходство киноринх со скребнями и с личинками волосатиков и приапулид .