ПОМК крысы: ген
Ген проопиомеланокортина крысы имеет структурно-функциональную организацию, сходную с геном ПОМК быка и с геном ПОМК человека и состоит приблизительно из 6000 нуклеотидных пар оснований ( рис.1м ) . Первый (интрон A) и второй (интрон B) интроны имеют размер 3000 и 1800 н.п., соответственно, ( Drouin J. ea, 1985 ). Сайт инициации транскрипции гена ПОМК был локализован экспериментально в экзоне 1 путем синтеза кДНК, начиная от праймеров комплементарных 5'-концевой транслируемой области мРНК ПОМК крысы, ее последующего секвенирования ( Oates E. ea, 1984 ) и сравнения с нуклеотидной последовательностью гена, а также сравнением со структурами генов ПОМК быка ( Nakanishi S. ea, 1981 ), человека ( Takahashi H. ea, 1983 ) и мыши ( Notake M. ea, 1983 ; Uhler M. ea, 1983 ).
Правильный TATA-бокс (TATAA) находится в 30 нуклеотидах с 5'-конца от сайта инициации транскрипции мРНК ПОМК. Между -67 и -47 позициями нуклеотидной последовательности гена ПОМК крысы находятся три последовательности, гомологичные консенсусу GG(C/T)CAATCT (CAAT-бокс). Показано, что такие последовательности важны для определения сайта и эффективности инициации транскрипции мРНК ПОМК, соответственно ( Drouin J. ea, 1985 ).
Энхансерные последовательности играют важную роль в активации транскрипции и, в некоторых случаях, определяют тканевую специфичность ( Rosenthal N., 1987 ). В составе нуклеотидной последовательности (-357, - 246, -188 и +85 позиции) гена проопиомеланокортина крысы были локализованы участки гомологичные (7/8) энхансерному консенсусу (GTGG(AAA/TTT)G) вируса типа SV40 и участки (позиции -257, -66 и +14) гомологичные (8/10) энхансерному консенсусу аденовирусов ( Drouin J. ea, 1985 ).
Из-за различий и сложности механизмов регуляции экспрессии гена ПОМК, наблюдаемых в гипофизе, особо важно определить, существуют ли в геноме множественные копии гена ПОМК, каждая, возможно, со своим механизмом регуляции и моделью тканеспецифической экспрессии, или уникальный ген ПОМК. В геноме крысы идентифицирован единственный ген проопиомеланокортина ( Drouin J. ea, 1987 ; Drouin J. ea, 1985 ).
Oates E. и Herbert E. выделили и секвенировали небольшие фрагменты двух различающихся мРНК ПОМК крысы ( Oates E. ea, 1984 ). Две последовательности мРНК ПОМК крысы отличаются друг от друга только вставкой размером 30 н.п.. Поскольку данная вставка находится на участке сплайсинга между экзонами 1 и 2, авторы ( Oates E. ea, 1984 ) утверждают, что две различающиеся мРНК крысы возникают в процессе альтернативного сплайсинга гена, а не транскрибируются с двух раздельных генов. Как оказалось, более короткая мРНК является предоминантной формой.
