Метилирование лизинов гистонов: общие сведения
Тот факт, что лизиновые остатки в гистонах метилированы, был известен многие десятилетия. Однако биологическое значение этой модификации стало высвечиваться лишь после идентификации первой метилтрансферазы лизинов, использующей гистоны в качестве своего субстрата ( Rea et al., 2000 ). В настоящее время идентифицировано большее количество лизиновых метилтрансфераз (HKMTs) , и определены сайты, модифицируемые ими на гистонах ( Martin and Zhang, 2005 ). Все эти ферменты, за исключением Dot1 , имеют общий домен SET , который содержит каталитически активный сайт и делает возможным связывание с S-аденозил-L-метиониновым кофактором.
Из большого числа известных метилированных сайтов к сегодняшнему дню хорошо охарактеризованы шесть: пять на НЗ (К4, К9, К27, К36, К79) и один на Н4 (К20). Метилирование по НЗК4, H3K36 и НЗК79 в целом было связано с активацией транскрипции, а остальные варианты - с репрессией ( табл. 10.1 ). Кроме того, два из этих сайтов - НЗК79mе и Н4К20mе - участвуют, как считается, в процессе репарации ДНК. Были идентифицированы специфические белки-связки, распознающие каждый из шести охарактеризованных сайтов метилирования ( рис. 10.4 ). Эти белки имеют домен узнавания лизина, относящийся к одному из трех разных типов: хромо, тюдор и PHD-повтор. Ниже каждая из этих охарактеризованных модификаций обсуждается более детально.
