Рис. 6.16(epig). Организация района центромеры 7 у N. crassa
Были собраны контиги 249, 255 и 21 релиза 7.0 геномной последовательности (http://www.broad.mit.edu/annotation/fungi/neurospora_crassa_7/index.html) и все кроме первых 400 т.о. последовательности контига 10, и этот объединенный файл последовательностей был проанализирован с инкрементом 200 п.н. на "индексы RIP" (ТрA/AрТ [синий цвет] и CpA+TpG/ApC+GpT [красный цвет]) ( Galagan et al., 2003 ; Selker et al., 2003 ; Galagan and Selker, 2004 ). Район длиной примерно 360 т.о. с высокой плотностью перемещаемых элементов (ТЕ), инактивированных RIP (остатки ретротранспозонов - синий цвет, остаток ДНК-транспозона - фиолетовый цвет), был обнаружен между маркерами, фланкирующими центромеру, которая была картирована генетически. Изображенный сегмент длиной приблизительно в 1.5 млн о. включает 383 аннотированных гена (над линией и под ней, чтобы показать гены в противоположных ориентациях), из которых только 20 коротких предсказанных гена находятся в пределах предсказанного центромерного района. Размеры перерывов в последовательности [sequence gaps] между контигами (позиции 0.5466, 0.6956 и 0.9058 млн о. на рисунке) неизвестны.
