Кристаллография и ЯМР-спектроскопия
Имеются значительные достижения в изучении пространственной структуры субдоменов рРНК с помощью ЯМР-спектроскопии и в исследовании структуры рибосомных белков с использованием методов ЯМР и кристаллографии.
Закристаллизованы отдельные рибосомные субчастицы и 70S рибосомы галофильных и термофильных бактерий. Получены картины дифракции для 50S субчастиц галофилов с разрешением 3 A, а также рибосом и субчастиц T. thermophilus с разрешением 7-20 A. Однако картины дифракции во много раз сложнее тех, с которыми приходилось иметь дело раньше при расшифровке структур несимметричных макромолекул, что затрудняет их интерпретацию. В результате наиболее распространена альтернативная стратегия определения структуры рибосом "по частям": через пространственные структуры индивидуальных рибосомных белков, субдоменов рРНК и их небольших комплексов. Выявленное в ходе этих исследований большое разнообразие пространственных структур рибосомных белков указывает на существование разнообразных механизмов распознавания белками специфических участков РНК, количество которых должно значительно превышать ограниченное число известных механизмов ДНК-белкового узнавания.
