Терминация транскрипции у бактерии E.coli
У E.coli обнаружены терминаторы транскрипции, распознаваемые РНК-полимеразой только в присутствии белкового фактора терминации rho , механизм действия которого хорошо изучен. Этот белок с молекулярной массой 46 кДа обладает РНК- зависимой нуклеозидтрифосфатазной активностью, которая необходима для его функционирования при терминации. Кроме того, для него характерна РНК:ДНК-хеликазная активность. Установлено, что фактор rho связывается с растущей цепью РНК в особых неструктурированных участках, называемых рат-сайтами (rut sites , от англ. rut - колея, выбоина), до того, как РНК-полимераза достигает терминатора .
В местах p-зависимой терминации транскрипции РНК- полимераза прекращает элонгацию . Считается, что роль p-фактора заключается в вытеснении РНК из транскрипционного комплекса во время таких пауз. E.coli и другие бактерии имеют еще один тип регулируемых терминаторов транскрипции, называемых аттенюаторами .
