РНК: избирательная деградация
Гетерогенное внутриклеточное распределение и депонирование РНК могут достигаться за счет ее избирательной защиты от деградации. Например, материнские транскрипты генов nanos , cyclin B и Hsp83 концентрируются в плазме переднего полюса ранних эмбрионов дрозофилы, однако часть РНК остается нелокализованной. РНК переднего полюса переходит в отпочковывающиеся клетки во время дробления ооцита, тогда как остающаяся РНК деградирует. Избирательную защиту РНК в плазме переднего полюса ооцитов обеспечивают полярные гранулы.
Другим примером избирательной дестабилизации и защиты мРНК является метаболизм материнской РНК гена PCNA в ооцитах асцидий . В цитоплазме этих ооцитов различают три основные зоны: центральную эктоплазму и периферийные участки, прилегающие к кортексу, между которыми находится миоплазма. Во время оогенеза не кодирующая белок РНК гена YC локализована вокруг ядра в перинуклеарном пространстве и постепенно переносится к кортексу. После оплодотворения РНК переходит в миоплазму и ассоциирует с цитоскелетом. 3'-Концевая последовательность YC-РНК комплементарна 3'UTR PCNA-РНК, а также 5'UTR РНК рибосомного белка L5 . Вначале синтезируемая PCNA-РНК распределена равномерно в цитоплазме, однако постепенно миоплазма становится свободной от нее. Предполагают, что дестабилизация происходит в результате образования в миоплазме двухцепочечных YC-PCNA РНК-РНК-гибридов. В отличие от этого L5-РНК, несмотря на значительную гомологию с YC-РНК, не дестабилизируется, а накапливается в миоплазме. Истинные механизмы, лежащие в основе различий поведения этих двух транскриптов, остаются неизвестными.
