10Sa РНК E coli, используемая при невозможности терминации трансляции
Если транслируемая бактериальная мРНК укорочена в своей 3'- концевой части и рибосома не находит в соответствующей рамке считывания терминирующий кодон, она не может закончить трансляцию с помощью стандартного механизма терминации. В такой ситуации рибосома останавливается на конце мРНК и с ней взаимодействует 10Sa РНК, кодируемая у E.coli геном ssrA, которая запускает процесс деградации частично синтезированного полипептида.
10Sa РНК, аминоацилированная остатком Ala на своем 3'-конце, подобном стандартной акцепторной последовательности тРНК, сочетает в себе свойства тРНК и мРНК. 10Sa РНК, как и тРНКAla, образует внутреннюю пару оснований G3:U70, которая необходима для специфического распознавания тРНКAla рибосомами. После взаимодействия с рибосомой эта РНК вступает в стандартный цикл трансляции: ее остаток Ala включается в недостроенную цепь полипептида. Вслед за этим рибосома транслирует короткую последовательность нуклеотидов 10Sa РНК, которая теперь функционирует в качестве матрицы, добавляя десять аминокислот - ANDENYALAA - в C-конец укороченной полипептидной цепи, и терминирует трансляцию на UAA-кодоне 10Sa РНК. C-Концевая олигопептидная последовательность освободившегося полипептида далее распознается специфической протеиназой, которая расщепляет этот полипептид, обеспечивая его утилизацию бактериальной клеткой в процессе катаболизма.
