Таблица 2.1
Таблица 2.1
Эффективность расщеплениякоротких последовательностей ДНК некоторыми распространенными рестриктазами
Рестриктаза | Последовательность олигонуклеотидов в окрестностях сайта рестрикции | Длина цепи, нт | Процент расщепления олигонуклеотида после инкубации в течение | |
---|---|---|---|---|
2 ч | 20 ч | |||
BamH I | CGGATCCG CGGGATCCCG CGCGGATCCCGC | 8 10 12 | 10 >90 >90 | 25 >90 >90 |
Bgl II | CAGATCTG GAAGATCTTC GGAAGATCTTCC | 8 10 12 | 0 75 25 | 0 >90 >90 |
Cla I | CATCGATT GATCGATC CCATCGATGG CCCATCGATGGG | 8 8 10 12 | 0 0 >90 50 | 0 0 >90 50 |
EcoR I | GGAATTCC CGGAATTCCG CCGGAATTCCGG | 8 10 12 | >90 >90 >90 | >90 >90 >90 |
Hind III | CAAGCTTG CCAAGCTTGG CCCAAGCTTGGG | 8 10 12 |
0 0 10 | 0 0 75 |
Nhe I | GGCTAGCC CGGCTAGCCG CTAGCTAGCTAG | 8 10 12 | 0 10 10 | 0 25 50 |
Pst I | GCTGCAGC TGCACTGCAGTGCA | 8 14 | 0 10 | 0 10 |
Pvu I | CCGATCGG ATCGATCGAT TCGCGATCGCGA | 8 10 12 | 0 10 0 | 0 25 10 |
Sac I | CGAGCTCG | 8 | 10 | 10 |
Sac II | GCCGCGGC TCCCCGCGGGGA | 8 12 | 0 50 | 0 >90 |
Sma I | CCCGGG CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA | 6 8 10 12 | 10 10 0 0 | 10 10 50 >90 |
Spe I | GACTAGTC ACTAGTCC CGGACTAGTCCG CTAGACTAGTCTAG | 8 10 12 14 | 10 10 0 0 | >90 >90 50 50 |
Sph I | GGCATGCC CATGCATGCATG ACATGCATGCATGT | 8 12 14 | 0 0 10 | 0 25 50 |
Xba I | CTCTAGAG GCTCTAGAGC TGCTCTAGAGCA CTAGTCTAGACTAG | 8 10 12 14 | 0 >90 75 75 | 0 >90 >90 >90 |
Xho I | CCTCGAGG CCCTCGAGGG CCGCTCGAGCGG | 8 10 12 | 0 10 10 | 0 25 75 |
Примечание. Курсивом выделены последовательности сайтов рестрикции. |