Таблица 2.1

Таблица 2.1

Эффективность расщеплениякоротких последовательностей ДНК некоторыми распространенными рестриктазами

Рестриктаза

Последовательность олигонуклеотидов в окрестностях сайта рестрикции

Длина цепи, нт

Процент расщепления олигонуклеотида после инкубации

в течение

2 ч

20 ч

BamH I

CGGATCCG

CGGGATCCCG

CGCGGATCCCGC

8

10

12

10

>90

>90

25

>90

>90

Bgl II

CAGATCTG

GAAGATCTTC

GGAAGATCTTCC

8

10

12

0

75

25

0

>90

>90

Cla I

CATCGATT

GATCGATC

CCATCGATGG

CCCATCGATGGG

8

8

10

12

0

0

>90

50

0

0

>90

50

EcoR I

GGAATTCC

CGGAATTCCG

CCGGAATTCCGG

8

10

12

>90

>90

>90

>90

>90

>90

Hind III

CAAGCTTG

CCAAGCTTGG

CCCAAGCTTGGG

8

10

12

0

0

10

0

0

75

Nhe I

GGCTAGCC

CGGCTAGCCG

CTAGCTAGCTAG

8

10

12

0

10

10

0

25

50

Pst I

GCTGCAGC

TGCACTGCAGTGCA

8

14

0

10

0

10

Pvu I

CCGATCGG

ATCGATCGAT

TCGCGATCGCGA

8

10

12

0

10

0

0

25

10

Sac I

CGAGCTCG

8

10

10

Sac II

GCCGCGGC

TCCCCGCGGGGA

8

12

0

50

0

>90

Sma I

CCCGGG

CCCCGGGG

CCCCCGGGGG

TCCCCCGGGGGA

6

8

10

12

10

10

0

0

10

10

50

>90

Spe I

GACTAGTC

ACTAGTCC

CGGACTAGTCCG

CTAGACTAGTCTAG

8

10

12

14

10

10

0

0

>90

>90

50

50

Sph I

GGCATGCC

CATGCATGCATG

ACATGCATGCATGT

8

12

14

0

0

10

0

25

50

Xba I

CTCTAGAG

GCTCTAGAGC

TGCTCTAGAGCA

CTAGTCTAGACTAG

8

10

12

14

0

>90

75

75

0

>90

>90

>90

Xho I

CCTCGAGG

CCCTCGAGGG

CCGCTCGAGCGG

8

10

12

0

10

10

0

25

75

Примечание. Курсивом выделены последовательности сайтов рестрикции.

Ссылки: