ING1-Ген: структура

В результате автоматизированного определения нуклеотидной последовательности обнаружено, что ген ING1 устроен относительно просто. Структура гена ING1 содержит по крайней мере два экзона: 5'-концевой экзон 1a и общий для обеих форм мРНК 3'-концевой экзон 2. Размер интрона между ними составляет 3-5 т.п.н. Изоформа мРНК ING1 1b также состоит из двух экзонов: экзона 1b размером 450 н.п. и общим для обоих форм экзона 2, размером 1845 н.п. Для всех экзон-интронных границ выполняется правило GT/AG, донорный и акцепторный сайты сплайсинга почти точно соответствуют опубликованным консенсусным последовательностям.

Анализ нуклеотидной последовательности геномного локуса ING1, в том числе прилегающих к экзонам интронных последовательностей, а также нетранскрибируемых последовательностей, предшествующих экзонам 1a и 1b, показал, что локус ING1 отличается необычно высоким содержанием нуклеотидов G и С. Каждому из трех экзонов ING1 сопутствует выраженный CpG-островок ( рис. 4 ), содержащий множество участков, не распознаваемых метил-чусвтвительными эндонуклеазами рестрикции. GpC-островок экзона 1b размером по крайней мере 933 н.п. содержит 68% C и G, отношение CG к GC составляет 0,99. CpG-островок, включающий экзон 1a и предшествующая ему последовательность содержит 57% C и G, экзон 2 содержит CpG-островок с 59% C и G. Наличие CpG островков может указывать на возможности регуляции экспрессии ING1 путем метилирования ДНК de novo. Выше предполагаемых начальных позиций экзонов 1a и 1b выявлены элементы Sp1 и NF-E2, связывающие соответствующие белки и защищающие ДНК от метилирования.

Ссылки: