ДНК-Топоизомераза II: общие сведения
ДНК-топоизомеразы II типа являются димерами или тетрамерами, которые в процессе релаксации/суперскручивания одновременно расщепляют две цепи ДНК [ 18 , 35 ]. Когда ДНК находится в расщепленном состоянии, каждая субъединица димера связана с 5'-фосфатом ДНК, при этом точки разрывов на комплементарных цепях, как правило, находятся на расстоянии четырех пар оснований друг от друга. Сегмент ДНК, подвергающийся расщеплению, называется воротным или G-сегментом ДНК (англ. Gate segment), а сегмент ДНК, протаскиваемый через разрыв, транспортируемым или Т-сегментом ДНК (англ. Transported segment). В результате последовательных изменений конформаций фермента пространство между двумя субъединицами димеров расширяется до такой степени, что транспортируемый сегмент может пройти между ними. Реакции, катализируемые ДНК-топоизомеразами II типа, требуют присутствия ионов Mg2+ и ATP. ДНК-топоизомеразы этого типа могут катализировать как реакции релаксации/суперскручивания, так и катенации / декатенации дуплексов ДНК.
