MPG ДНК-гликозилаза: пространственная структура
По своей структуре и топологии белок MPG уникален среди ДНК-гликозилаз и не принадлежит ни к одному из описанных выше семейств [ Lau, ea 1998 , Lau, ea 2000 ]. MPG состоит из единственного a/b-домена, в котором антипараллельный b- слой окружен несколькими a-спиралями. Две из b-складок белка образуют b- шпильку, которая в комплексе MPG-ДНК внедряется в малую бороздку ДНК. Так же, как и в случае Ung/UNG, OGG1 и AlkA, ДНК в комплексе с MPG сильно изломана, поврежденный дезоксинуклеотид вывернут из двойной спирали и вставлен в активный центр белка, а межцепочечная полость в ДНК заполнена остатком белка (Tyr162). Структура фермента в комплексе с ОДН, содержащим eAde [ Lau, ea 2000 ], показывает, что при узнавании поврежденного основания активный центр фермента вообще не образует с ним специфических водородных связей. Возможно, что узнавание происходит за счет пи-пи и катион-пи взаимодействий с остатками Tyr127, His136 и Tyr159, и что нестабильность N-гликозидной связи положительно заряженных метилированных дезоксинуклеотидов вносит значительный вклад в специфичность MPG [ O'Brien, ea 2004 ].
