Процессивность ДНК-гликозилаз

Фермент DenV стал первой ДНК-гликозилазой, для которой была показана процессивность расщепления поврежденной ДНК [ Lloyd, ea 1980 , Gruskin, ea 1986 ]. Это явление обнаруживается в том, что при расщеплении ферментом УФ-облученной плазмидной ДНК ее линейная форма накапливается гораздо быстрее, чем можно было бы ожидать при полностью независимых друг от друга актах расщепления ЦПД, случайным образом распределенных по длине плазмиды. Следовательно, расщепление ДНК по одному ЦПД повышает вероятность ее расщепления по ЦПД поблизости от него; если два ЦПД разнесены на расстояние не более 12-16 п.н., образуется линейная форма плазмиды. В качестве объяснения этого феномена была предложена модель коррелированного поиска, при котором фермент связывает ДНК и диффундирует вдоль нее, пока не достигнет поврежденного звена; если произошло первое расщепление, то фермент не уходит из комплекса с ДНК, а остается связанным с ДНК и вновь начинает коррелированный поиск. Аналогичная модель поиска поврежденных оснований предлагалась затем и для других ДНК-гликозилаз [ Bennett, ea 1995 , Higley, ea 1993 , Francis, ea 2003 ].