ДНК участок связывания гомеобоксных белков
Гомеотические гены позвоночных и растений играют ключевую роль в морфогенезе . Полипептидные цепи белков, кодируемых этими генами, содержат высококонсервативную последовательность длиной в 60 аминокислотных остатков, (гомеобокс или гомеодомен), которая определяет специфичность взаимодействия белков с регуляторными последовательностями ДНК. Анализ третичной структуры гомеодоменов показал, что они образуют структуру типа "спираль-поворот-спираль" (helix-turn-helix), в которой за альфа-спиральным участком следует бета-структура с последующим еще одним альфа-спиральным участком . Наличие этой пространственной структуры, существование которой было предсказано на основании гомологии с соответствующими аминокислотными последовательностями бактериальных белков- репрессоров, доказано методами ЯМР-спектроскопии, в частности, для гомеодомена продукта гена Antennapedia дрозофилы. Гомеодомен-содержащие белки обнаружены теперь у всех изученных эукариот, от дрожжей до человека.
Гены N-CAM и цитотацина (тенасцина) (белков внеклеточного матрикса) обладают потенциальными участками связывания белков, кодируемых генами гомеобокса:
-ATTATTA-...-ATTA-
Белок Evx1 активирует ген цитотактина путем специфического связывания с мишенью в области промотора:
-CTGAGTCAT-
-GACTCAGTA-
