Ii-цепь
Антигены MHC класса II на самых ранних этапах своего метаболизма ассоциированы с инвариантной третьей цепью, кодируемой в хромосоме 5 человека и обозначаемой как Ii-цепь ( CD74 ). Для этого белка характерно высокое содержание метионина и существование 4-х изоформ, получающихся в результате использования 2-х инициирующих кодонов и альтернативного сплайсинга одного из экзонов. Инвариантная цепь гликозилирована N- и *O- связанными олигосахаридами. Находящиеся в избыточном количестве Ii-цепи и вновь синтезированные альфа- и бета-цепи образуют комплексы, подвергающиеся внутриклеточному транспорту. Считается, что Ii-цепь предотвращает связывание эндогенных пептидов с антигенами MHC класса II. Связывание с последними экзогенных пептидов происходит после диссоциации альфа/бета-димера и Ii-цепи.