BTB-домен GAGA-фактора
Наиболее хорошо исследованным ВТВ-содержащим белком является GAGA-фактор , который называется так потому, что связывается с GAGA-последовательностями [ Katsani К.R. et al., 1999 ].
Сайты связывания для GAGA-фактора были найдены рядом с промоторами многих генов, в частности много сайтов присутствует в промоторной области генов теплового шока . На примере последних было показано, что GAGA-фактор может вытеснять нуклеосомы из промоторной области, тем самым способствуя связыванию с промотором основных факторов транскрипционного комплекса .
GAGA-фактор содержит на N-конце ВТВ-домен , имеющий высокую степень гомологии с ВТВ-доменом белка Моd(mdg4) , на С-конце белка находится ДНК-связывающий домен "цинковые пальцы" [ Orihara М. et al., 1999 ]. Было продемонстрировано, что шесть молекул GAGA-фактора взаимодействуют между собой посредством ВТВ-доменов, после чего образовавшийся комплекс эффективно связывается с GAGA-сайтами, которые могут находиться на расстоянии 1-2 т.п.н. друг от друга [ Orihara М. et al., 1999 ]. В результате этого происходит выпетливание ДНК, что можно наблюдать экспериментально.
Для промотора гена engrailed было показано, что GAGA-сайты, расположенные рядом с энхансером и промотором, необходимы и достаточны для их взаимодействия [ Ohtsuki S., Levine М., 1998 ].
Более того, в некоторых случаях GAGA-сайты могут выполнять инсуляторную функцию [ Yoshida С. et al., 1999 ]. Косвенным подтверждением роли GAGA-фактора в инсуляции является присутствие GAGA-сайтов в последовательностях инсуляторов, которые разделяют регуляторные домены в Abd-B-гене [ Mihaly J. et al., 1998 ].
