GGGA в природных промоторах T. aquaticus и T. thermophilus
Некоторые из промоторов T. aquaticus и T. thermophilus содержат GGGA-подобные мотивы справа от -10 элемента ( Рис. 3.2 А). Установлено, что мотивы, родственные GGGA-элементу, содержатся примерно в 30% всех промоторов, что указывает на важную функциональную роль этого элемента в их узнавании.
Промотор гена dnaK содержит GGGA-элемент наряду с -10 и -35 элементами ( Рис. 3.2 А). Экспериментально подтверждено, что GGGA-мотив в промоторе dnaK специфически узнается РНК-полимеразой (РНКП) T. aquaticus и способен обеспечивать инициацию транскрипции данной РНКП в отсутствие -35 элементат ( Рис. 3.2 Б). РНКП E. coli обладает заметно меньшей активностью на dnaK-промоторе, чем РНКП T. aquaticus. Замена GGGA не оказывает влияния на эффективность транскрипции РНКП E. coli, тогда как при замене -35 элемента, либо обоих элементов, активность пропадает ( Рис. 3.2 ).
Таким образом, полученные результаты показывают, что GGGA-элемент играет важную роль в узнавании различных природных промоторов РНКП T. aquaticus.
