Дискриминатор (элемент промотора)

Некоторые промоторы E. coli (в частности, промоторы рибосомальной РНК, генов биосинтеза аминокислот и нуклеотидов) содержат справа от -10 элемента, в районе, соответствующем GGGA-элементу, C/G-богатый участок (с преобладанием С в нематричной цепи ДНК) - дискриминатор ( Travers, 1980 ). Было показано, что наличие дискриминатора определяет низкую стабильность комплексов, образованных РНКП на таких промоторах ( Gourse et al., 1998 ; Jung and Lee, 1997 ; Lamond and Travers, 1985 ; Pemberton et al., 2000 ). Проведенные исследования продемонстрировали, что нестабильность промоторных комплексов в этом случае определяется неоптимальной последовательностью ДНК в участке дискриминатора и отсутствием стабилизирующих контактов района 1.2 сигма-субъединицы с нематричной цепью ДНК. Аналогичный вывод о функциональной роли дискриминатора был сделан при изучении механизмов взаимодействий РНКП E. coli с промоторами рибосомальной РНК ( Haugen et al., 2006 ; Haugen et al., 2008b ).

Ссылки: