Механизм образования открытого промоторного комплекса: резюме
РНК-полимеразы (РНКП) E. coli, D. radiodurans и T. aquaticus различаются по температуре открывания промоторов и стабильности промоторных комплексов. Эти изменения не связаны с температурной адаптацией. Для поиска функционально-важных участков РНКП разработан методический подход - анализ химерных ферментов, содержащих последовательности разных бактерий. Показано, что различия в температуре открывания промоторов разными РНКП определяются неконсервативными аминокислотами консервативного района 2 сигма-субъединицы и N-концевой частью сигма-субъединицы; различия в стабильности промоторных комплексов определяются N-концевой частью сигма-субъединицы и кор-ферментом РНКП.
Важную роль в стабилизации промоторных комплексов играют специфические контакты сигма-субъединицы с участком ДНК правее -10 элемента (в области GGGA-элемента ), а также неспецифические контакты кор-фермента с ДНК спереди по ходу транскрипции.
