Роль GGGA-элемента в узнавании промоторов РНКП: резюме
Новый элемент промоторов бактерий - GGGA-элемент - расположен справа от -10 элемента и узнается районом 1.2 сигма-субъединицы. GGGA- содержащие промоторы узнаются РНК-полимеразой (РНКП) разных бактерий с различной эффективностью; межвидовые различия в узнавании GGGA- содержащих промоторов зависят от неспецифических контактов РНКП с промоторной ДНК. GGGA-элемент расширяет список известных промоторных элементов бактерий, включающий также -10, -35, TG и UP-элементы, причем четыре из перечисленных элементов узнаются различными районами сигма- субъединицы ( Рис. 2.1 ). Наличие большого числа независимо узнаваемых элементов промотора открывает широкие комбинаторные возможности для создания промоторов, обладающих разным уровнем активности. Использование аптамеров может быть применено в дальнейшем для анализа механизмов узнавания промоторов РНКП различных бактерий и поиска новых промоторных элементов.
