Табл. 10(lp). Фрагменты ОРС в метагеномных последовательностях

Результаты автоматического поиска фрагментов ОРС в метагеномных последовательностях с помощью сервиса MG-RAST.

Станция ДРУЖНАЯ: Число последовательностей - 101717; Число генов РНК - 799; Число предсказанных белков с известными функциями - 71125; Число предсказанных белков с неизвестными функциями - 20320. 

Станция ЛЕНИНГРАДСКАЯ: Число последовательностей - 315145; Число генов РНК -1713 ; Число предсказанных белков с известными функциями - 229753; Число предсказанных белков с неизвестными функциями - 64599. 

Станция МИРНЫЙ: Число последовательностей - 273540; Число генов РНК - 1862; Число предсказанных белков с известными функциями - 88170; Число предсказанных белков с неизвестными функциями - 31495. 

Станция ПРОГРЕСС Число последовательностей - 104834; Число генов РНК - 331; Число предсказанных белков с известными функциями - 64187; Число предсказанных белков с неизвестными функциями - 31495. 

В таблице приведены размеры метагеномных библиотек и количество ДНК последовательностей, которые содержат фрагменты ОРС, кодирующие белки с известной или неизвестной функцией, или содержат последовательности генов рРНК.

Ссылки: