Микоплазмы: повторяющиеся элементы, не гомологичные IS
В состав генов микоплазм входят повторяющиеся последовательности, не имеющие гомологии с IS-элементами. Из 679 ОРС M. pneumoniae повторяющиеся элементы входят в состав 26 ОРС, в том числе RepMP2/3 (10 ОРС), к повторяющимся последовательностям относятся RepMP4 (8 ОРС) и RepMP5 (8 ОРС) ( Herrmann, Reiner, 1998 ). Сходные элементы MgPar повторяются в геноме M. genitalium 14 раз ( Peterson et al., 1995 ). Последовательности повторяющихся элементов семейства MgPar обладают гомологией с генами MG191 и MG192 оперона MgPa, кодирующего белки, обеспечивающие адгезию микоплазмы к эукариотной клетке.
Часть гена ОРС6 M. pneumoniae, расположенного в том же опероне, что и ген белка Р1, также представлена в хромосоме несколькими копиями. Перемещающиеся генетические элементы (они же - повторяющиеся последовательности) входят в состав генов, кодирующих главный адгезин M. genitalium, гемагглютинин M. gallisepticum и 135 кДа поверхностный антиген M. hominis PG21 ( Markham et al., 1993 , Markham et al., 1994 ; Ladefoged et al., 1995 ). В геномах ряда микоплазм обнаружен класс подвижных элементов ДНК, которые кодируют белки, гомологичные бактериальным и эукариотическим белкам, связывающим тяжелые металлы. Уровень повторяемости генов этих белков определяется генетическими перестройками ( McIntosh et al., 1992 ).
В составе элемента MgPar M. genitalium можно выделить шесть сегментов, пять из которых гомологичны фрагментам генов, входящих в оперон MgPa M. pneumoniae.
Шестой сегмент локализован по середине повторяющегося элемента и представляет собой АТ-богатую последовательность, характерную только для данного семейства повторяющихся элементов. Нуклеотидные последовательности пяти сегментов содержат ОРС, гомологичные аминокислотным последовательностям белков MgPa.
Однако все эти ОРС прерываются терминаторными кодонами и не кодируют экспрессируемые полипептиды. Показано, что рекомбинация, происходящая между повторяющимися элементами MgPar и генами оперона MgPa, приводит к антигенным вариациям белков, обеспечивающих адгезию микоплазмы ( Peterson et al., 1995 ).