Микоплазмы: протеомика: нерешенные задачи
Более 90% ОРС в геномах Mycoplasma genitalium и M. pneumoniae точно или приблизительно определено ( Himmellreich et al., 1997 ), однако остается еще большая работа по расшифровке и классификации кодирующих областей, для которых не найдены гомологичные последовательности в существующих базах данных.
Остается огромный объем работы по экспериментальному подтверждению функций, предсказываемых на основании первичной структуры. Основная трудность в идентификации генов по компьютерной базе данных состоит в том, что требуемая степень идентичности (процент гомологии) не может быть определена точно и этот подход ограничен генами или белками, которые были определены на других организмах.
Построение функциональных генетических карт на основе данных по первичной структуре ДНК может быть затруднено наличием "молчащих" генов или криптических оперонов с вполне узнаваемыми генами, которые, однако, не могут экспрессироваться из-за отсутствия функционирующих промоторов, из-за мутаций или инсерций генетического материала, препятствующих нормальной экспрессии или ее регуляции.
Ожидается появление полных нуклеотидных последовательностей многих организмов, в том числе всех микоплазм, представляющих практический интерес для медицины и сельскохозяйственного производства. Возможность предсказать функцию продукта гена становится особенно важной.
