Тест для сравнения скоростей эволюции

Отсутствие однозначных датировок времени дивергенции для многих видов порождает сложности при выяснении вопроса о равномерности темпов эволюции в тех или иных филогенетических линиях. Чтобы избежать этого Сэрих и Вильсон ( Sarich and Wilson, 1973 ) предложили тест для сравнения темпов эволюции (relative-rate test).

Допустим мы сравниваем темп в линиях ведущих от общего предка O к видам A и B. Тогда нам нужен еще и вид С в качестве репера. Мы должны быть уверены, что вид С отделился от общего ствола раньше, чем разделились виды A и B. 

            
┌────┴─────┐
             │          │
           O │          │
         ┌───┴───┐   
  │
         │       │      │
         │       │      │
         A       B      C

Из рисунка видно, что число различий между A и C равняется сумме расстояний от точки A до O и от точки O до C:

K(AC)=K(AO)+K(OC) Аналогично

K(BC)=K(BO)+K(OC)

K(AB)=K(AO)+K(BO) Мы можем прямо оценить K(AB),K(AC) и K(BC), следовательно можем вычислить и K(AО),K(BO) и K(CO):

K(AO)=(K(AC)+K(AB)-K(BC))/2

K(BO)=(K(BC)+K(AB)-K(AC))/2

K(CO)=(K(AC)+K(BC)-K(AB))/2

Теперь мы можем сравнить K(AO) и K(BO), что и являлось нашей целью. Следует отметить, что более грубое сравнение можно произвести сразу сравнивая значения K(AС) и K(BС). Часто в качестве критерия используется разница K(AО)-K(BО) или K(AC)-K(BC), чем она ближе к 0, тем более близки темпы эволюции в соответствующих линиях.

Ссылки: