Интерференция на внутригенном уровне
Как и на макроуровне, на микроуровне рекомбинации в соседних участках не являются событиями независимыми. Однако характер интерференции на микроуровне существенно отличается от интерференции на макроуровне. На макроуровне частота множественных обменов на коротких участках практически всегда оказывается меньше ожидаемой (см." Интерференция "). При изучении рекомбинации на молекулярном уровне, наоборот, на коротких расстояниях обнаруживается избыток рекомбинационных событий. Это возникает из-за того, что рекомбинация на молекулярном уровне не является точечным событием, а как бы "размазана" по довольно протяженному району ДНК - району гетеродуплекса . Гетеродуплекс является активной рекомбинационной зоной, в которой чрезвычайно велика вероятность конверсии гетерозиготных сайтов. Наличие протяженного гетеродуплекса приводит к тому, что близко расположенные гетерозиготные сайты с высокой вероятностью подвергаются совместным рекомбинационным событиям, прежде всего конверсии.
Мортинер и Фогель ( Mortiner, Fogel; 1985 ) исследовали влияние конверсии на частоту кроссинговера в достаточно удаленном участке хромосомы, заведомо не связанном с исходным участком общим гетеродуплексом. Было показано, что конверсия вызывает хиазменную (не хроматидную) интерференцию только в том случае, если она сопровождается кроссинговером - разрезанием необменных нитей ДНК в полухиазме . Интерференция отсутствует, если конверсия не сопровождается кроссинговером фланговых маркеров . Таким образом, потенциальные сайты кроссинговера - сайты формирования гетеродуплекса - распределены по хромосоме независимо друг от друга; в то же время, тип рекомбинационного события - конверсия или кроссинговер - зависит от типа рекомбинационных событий в соседних участках. Кроссоверный обмен не изменяет вероятность генетической конверсии в соседних районах хромосомы, однако увеличивает вероятность того, что эта конверсия не будет сопровождаться кроссинговером.
