IFN-зависимые гены: активация транскрипции
Такие интерферонзависимые гены как 6-16 , ISG-54 и другие в своей 5'-концевой области содержат похожую последовательность, которая, по-видимому, участвует в интерферонзависимой активации транскрипции. Первоначально эта последовательность была обнаружена в генах HLA и металлотионеина, а затем в ряде интерферонзависимых генов. Она была названа Interferon Response Sequence ( IRS , или ISRE ). Эта последовательность присутствует в самом гене b-IFN (табл. I). Эти 13- или 14-нуклеотидные IRS последовательности высоко гомологичны (консенсус: G/AGGAAAN(N)GAAACT), промоторные фрагменты, содержащие их, связывают in vitro IFN-индуцированные и основные факторы ( Cohen et al., 1988 ; Levy et al., 1988 ; Porter et al., 1988 ).
В 5'-регуляторной области (-77/-36) b-IFN, названной Interferon Gen Regularory Element ( IRE , Goodbourn et al., 1986 ) был также найден повторяющийся гексануклеотидный мотив (AAGTGA) ( Fujita et al., 1985, 1987 ). Авторы полагают, что этот мотив регулирует связывание транскрипционных факторов ( Miamoto et al., 1988 ). В мышиных клетках к нему присоединяется белковый фактор IRF-1 . Тот же самый повтор может быть найден в области ISRE. Работы Porter et al. (1988 ) показывают, что олигонуклеотид GGGAAAATGAAACT конкурирует с IRS-областью гена 6-16, а олигонуклеотид GGGAAAATGACACT (с одной заменой) - нет.
В лаборатории молекулярных основ онкогенеза были проведены работы по сравнению области IRS интерферонзависимых генов и гена c-myc . Было обнаружено, что консенсусная последовательность регуляторной области интерферонзависимых генов, GGAAAN GAAA, также присутствует в 5'-концевом участке человеческого гена c- myc в позициях -76/-67. Эксперименты по транскрипции in vitro в плазмидах, содержащих c-myc, показывают, что этот консенсусный участок конкурирует с двухцепочечным олигонуклеотидом GGGAAAATGAAACT за связывание специфических белков.
Таблица I.
Последовательность нуклеотидов интерферон-зависимых генов в области IRS ( Interferon Response Sequence ).
| Ген (человек) | Последовательность | Ссылка |
|---|---|---|
| F/S консенсус | GA A GGA GAAA CTG | Friedman, Stark (1985) |
| ISG15 | GGAAA CC- GAAA CT | Reich et al. (1987) |
| ISG54 | GGAAA AT- GAAA CT | Porter et al. (1988) |
| 2'-5' олиго- А-синтетаза | GGAAA GT- GAAA CT | Reich et al. (1987) |
| IP-10 | GGAAA GT- GAAA CT | Laster, Ravetch (1987) |
| 6-16 | GGAAA C-- GAAA CC | Rutherford et al. (1988) |
| b-IFN | GGAAA ACT GAAA G | Goodbourn et al. (1985) |
