PARP (ПАРП): модель хроматинзависимой репарации ДНК
Динамика репарации ДНК очень сильно зависит от присутствия гистонов на поврежденной ДНК. Поли(АДФ-рибозил)ирование гистонов в ответ на повреждение ДНК позволяет предполагать, что ПАРП играет огромную роль в репарации ДНК, когда ДНК структурирована в хроматин. Так как активность ПАРП индуцирована разрывами ДНК, хроматиновые структуры разворачиваются из-за соседних повреждений ДНК (обусловленных поли(АДФ-рибозил)ированием гистона Н1 и коровых гистонов ), и это локальное повреждение хроматиновой конфигурации может оказаться критическим для репарации высококонденсированного хроматина ( de Murcia et al., 1988 ). Иллюстрацией этому служит следующий факт: в отсутствие активности ПАРП репарация нетранскрибируемых регионов генома значительно менее эффективна, чем транскрибируемых. Нетранскрибируемые регионы часто имеют конденсированную хроматиновую структуру, тогда как активно транскрибируемые обладают преимущественно открытой хроматиновой структурой, что делает их доступными для таких белков, как транскрипционные факторы или те же ДНК-репарирующие белки . В пользу этой гипотезы свидетельствует то, что поли(АДФ-рибозил)ирование делает обратимым процессинг гетерогенных нуклеаз.
Подобно этому, ПАРП может облегчить репарацию ДНК, происходящую при плотной упаковке хроматина. Такую гипотезу подтверждает следующий факт: некоторые факторы репарации ДНК и ДНК-сигнальные факторы действуют как большой многокомпонентный белковый комплекс (примером может служить ЭР-репарация ). Нетрудно представить, что работе таких больших комплексoв будет препятствовать высококонденсированный хроматин и что хроматиновая деконденсация поможет им выполнить свои функции. Остается открытым вопрос, оказывает ли поли(АДФ-рибозил)ирование влияние на репарацию ДНК путем изменения структуры хроматина.
