Ген протеина S
Gene: [03^/PROS1] protein S, alpha (activated protein-C cofactor; vitamin K-dependent)
Ген протеина S (PS aльфа или PROS1) и псевдоген S (PS бета или PROS2) локализованы на 3 хромосоме человека в позиции p11.1-q11.2 ( Naylor S.L.,1987 ; Long G.L.,1988 ; Watkins P.C.,1987 ; Watkins P.C.,1988 ).
кДНК протеина S человека клонирована в 1986-87 годах ( Lundwall A.,1986 ; Hoskins J.,1987 ; Ploos van Amstel H.K.,1987a ).
Нуклеотидная и аминокислотная последовательности гена протеина S представлены на Рис. F S seq.
Зрелый протеин S - одноцепочечный гликопротеин, состоящий из 635 аминокислотных остатков, образуемых в результате пострансляционной модификации белка-предшественника из 676 аминокислот ( Dahlback B.,1986a ; Lundwall A.,1986 ; Hoskins J.,1987 ). Пептид содержит 3 сайта гликозилирования (Asn 458, 468, 489) и 7 функциональных доменов. Сигнальный пептид (от -41 до - 18) содержит гидрофобные последовательности, обеспечивающие транслокацию пептида через грубый эндоплазматический ретикулюм; пропептид (от 17 до -1) обеспечивает гамма-карбоксилирование. Зрелый пептид состоит из ряда сегментов: Gla области из 37 аминокислот, линкерной области из 36 аминокислот, четырех EGF-подобных сегментов (в каждом из которых 45 аминокислот) и концевого домена из 387 аминокислот, гомологичного связывающим белкам стероидных гормонов (SHBG).
Ген протеина S человека (PROS1) клонирован в 1990 году ( Schmidel D.K.,1990 ; Ploos van Amstel H.K.,1990 ; Edenbrandt C.M.,1990 ). Его протяженность более 80 килобаз ( Schmidel D.K.,1990 ; Ploos van Amstel H.K.,1990 ; Edenbrandt C.M.,1990 ). Ген образует 3 mРНК ( Lundwall A.,1986 ; Hoskins J.,1987 ; Ploos van Amstel H.K.,1987a ). Состоит ген из 15 экзонов и 14 интронов с 6 Alu последовательностями ( Hoskins J.,1987 ; Schmidel D.K.,1990 ; Hall A.J.,1995 ). I и XV экзоны включают 112 и 1139 пар оснований 5' и 3' нетранслируемых областей, соответственно. Анализ промоторной области гена не выявил "TATA" последовательность. В данной области гена кластерированы GC-обогащенные сегменты, локализованные перед стартовой точкой за 30-80 нуклеотидов, напоминающие транскрипционные факторы SPI.
Экзон-интронные сочленения гена протеина S представлены в Таблице F S int.
К настоящему времени клонированы также гены S протеина коровы ( Dahlback B.,1986b ), кролика ( He X.,1993 ), мыши ( Chu M.D.,1994 ), крысы ( Yasuda F.,1995 ), свиньи и обезьяны ( Greengard J.S.,1995 ).
Псевдоген протеина S человека (PS бета или PROS2) утрачивает 1 экзон и содержит множественные замены оснований в кодирующей части гена ( Ploos van Amstel H.K.,1987b ; Ploos van Amstel H.K.,1990 ; Edenbrandt C.M.,1990 ).
Первая мутация в гене протеина S определены в 1996 году. К настоящему времени известны 96 missense, 36 терминующих и 28 сплайсинговых мутаций, а также делеции и инсерции. Идентифицированные мутации представлены в Таблице S m.
В 3'нетранслируемой области гена (3'- UT) выявлены случаи полиморфизма: A-G в положении 2148 нуклеотида и A-C в положении 2698 нуклеотида ( Leroy-Matheron C.,1999 ); C-T и T-С в положениях 296 и 286, соответственно ( Espinosa-Parrilla Y.,2000c ; Espinosa-Parrilla Y.,1999 ).
