Выделение ДНК, свяывающейся с ядерным матриксом (MAR/SAR): введение
Один из классических подходов, используемых для изучения ДНК-белковых комплексов, состоит в полной или частичной реконструкции этих комплексов in vitro. Первоначальные попытки применить этот подход для идентификации поcледовательностей ДНК, участвующих в закреплении концов петель ДНК на ядерном матриксе, не были успешными. Хотя ядерный матрикс содержит большое количество ДНК-связывающих белков, комплексы ДНК с этими белками не были устойчивыми к солевой экстракции [ Mullenders ea 1982 ]. Не обнаружено выраженной предпочтительности связывания белками ядерного матрикса определенного класса последовательностей ДНК (например, фракции прикрепленной к ядерному матриксу ДНК по сравнению с суммарной ДНК). Принципиально иные результаты были, однако, получены Кокериллом и Гаррардом [ Cockerill ea 1986 , Cockerill ea 1986 ] в опытах по связыванию in vitro фрагментов клонированной ДНК с препаратами ядерного матрикса (Выделение MAR (Matrix Associated Regions).