Участки взаимодействия малой рибосомной субчастицы с мРНК и аминоацил-тРНК
Характерным моментом инициации трансляции является то, что на этом этапе участвуют не целые рибосомы, а их отдельные субчастицы. Другими словами, для того чтобы инициировать трансляцию, рибосома должна быть диссоциирована на две составляющие ее неравные субчастицы. Для этого клетка располагает специальными механизмами, обеспечивающими диссоциацию рибосом после терминации трансляции. Именно малая субчастица рибосомы ( 30S у прокариот и 40S у эукариот), и только она, связывается с мРНК , то есть служит первичным приемником генетической информации для белоксинтезирующего аппарата. Лишь впоследствии, при завершении этапа инициации трансляции, к ней присоединяется большая субчастица (50S у прокариот и 60S у эукариот), образуя полную рибосомную частицу ( 70S у прокариот и 80S у эукариот), которая и будет производить элонгацию. В процессе элонгации рибосома удерживает мРНК и движется относительно ее (или протягивает ее сквозь себя) в направлении от 5'-конца к 3'-концу. Удержание мРНК на рибосоме есть целиком и полностью функция малой рибосомной субчастицы, в то время как большая субчастица с мРНК никак не взаимодействует. Соответственно последовательное сканирование кодирующей последовательности мРНК (считывание генетической информации) в ходе элонгации осуществляется на малой субчастице транслирующей рибосомы. Механизм потриплетного сканирования мРНК в ходе элонгации предполагает участие молекул тРНК , которые взаимодействуют прежде всего с малой рибосомной субчастицей.
Малая субчастица в составе полной транслирующей рибосомы имеет два тРНК-связывающих участка, обозначаемых как аминоацил- тРНК-связывающий участок ( А-участок ) и пептидил-тРНК-связывающий участок ( Р-участок ). На этапе элонгации Р-участок всегда занят остатком тРНК.