МикроРНК (miRNA): регуляция экспрессии
Экспрессия lin-4 и let-7 регулируется в процессе развития; РНК lin-4 накапливается на второй личиночной стадии, а РНК let-7 - на четвертой. Некоторые из обнаруженных микроРНК также показывают зависимую от периода развития экспрессию, указывая на то, что гены микроРНК могут отвечать на различные сигналы развития.
Хотя некоторые микроРНК, кодируемые интронами, могут возникать как побочный продукт в процессе сплайсинга пре-мРНК, большинство микроРНК ведут свое происхождение из межгенных областей и, возможно, транскрибируются с автономных промоторов микроРНК, как в случае lin-4 и let-7.
Ключевыми в данном случае являются следующие вопросы:
- какие РНК-полимеразы транскрибируют эти гены,
- как устроены их регуляторные последовательности и
- какие транскрипционные факторы привязывают их экспрессию к сигналам развития?
Синтез некоторых конститутивно транскрибируемых микроРНК может регулироваться уровнем процессинга зрелого транскрипта из его предшественника. Среди обнаруженных у C. elegans микроРНК есть и такие, которые процессируются весьма неэффективно, в большинстве случаев оставляя предшественник нетронутым ( Lee и Ambros, 2001 ). Они могут представлять собою класс РНК, процессирующихся лишь при определенных условиях, подразумевающих наличие белка Dicer и/или других компонентов микроРНК.
Большинство генов микроРНК представлены в геноме отдельными копиями, но важная часть их находится в кластерах, содержащих множество генов микроРНК, транскрибирующихся, очевидно, в виде длинного предшественника, а затем процессирующихся до индивидуальных микроРНК ( Lagos-Quintana и др., 2001 , Lau и др., 2001 ). Собранные в кластеры микроРНК иногда сходны по последовательности, но могут быть и различными. Результат действия некоторых кластеров микроРНК может представлять собою множественную атаку на общую мишень либо координированный контроль ряда независимых мишеней.