snRNP (мяРНП): роль в сплайсинге
В ходе узнавания канонических последовательностей при сплайсинге они спариваются с основаниями РНК, что приводит к образованию вторичной структуры РНК, которая и будет взаимодействовать с ферментом. При этом конформация РНК играет такую же роль, как и в случае других ферментативных реакций при процессинге РНК (хотя здесь на спаривание оснований оказывают влияние и белки).
Прототипом явлений распознования с участием мяРНК является взаимодействие между U1 и 5' сайтом сплайсинга. Первоночальное предположение, что U1 узнает сайт сплайсинга посредством прямого Уотсон-Криковского спаривания основано единственно на комплементарности канонических последовательностей и 5' конца U1 мяРНК ( Lerner M.R.,1980 , Rodgers J.,1980 ). Эта модель (в модифицированной форме) была последовательно проверена биохимически и генетически и служит парадигмой для роли мяРНК в других реакциях процессинга РНК ( Steitz J.A., 1988 ).
Модель, обьясняющая как происходит спаривание 11 концевых нуклеотидов U1-мяРНК человека с границами экзон-интрон приведена на рисунке 2. Показано, как осуществляется спаривание оснований мяРНК и последовательностей, находящихся на концах типичного интрона. Как в точности происходит спаривание оснований предсказать трудно, поскольку последовательность UCC U1-мяРНК может спариться с AGG, находящейся на любой из границ экзон-интрон. Способностью к спариванию обладает частица в целом; очищенная U1 РНК связываться с границей сплайсинга не может.
Участки мяРНК и факторы, участвующие в связывании (см.далее).
