Таб.06 spl Элайнмент структур U5 мяРНК

Ib'     IL1'    Ia'                   Sm site           Stem/Loop II 
**************************************************************************

* 120      130    140  *  150    160    170         180 -190-200  210    *

*GGUGUU--AUAGAA--GUAA--*CCGUUACUGUGG--UAUUUUUUGG  AACU--UGCCCU--GGCG
U...*S.c. 
*UGUCAG--AUUAG.--CGGC--*AUACGCU.....--AGU.UUUUGG  A...--AGAGUU--CUCU
G...*Pea 
*UGGAGA--AACUC.--GAGU--*CUUAAAC.....--AAUUUUUUGA  ....--GGCCUU--GGCU
A...*Mouse 
*UGGAGA--AACUCU--GAGU--*CUUAAAC.....--AAUUUUUUGA  ....--GCCUUG--AGGC
UA..*Human 
*                      *                                                 *

*uG.r..--A.....--..g.--*.y..........--aaU.UUUUgR  ....--r..yy.--r..y
....*Cons 
**************************************************************************

5 ' Концевой домен               3' концевой домен  Часть 2. 
Приведены выравненные последовательности 
S.c. (Saccharomyces cerevisiae), 
Pea, 
Mouse, 
Human. 
Указанные позиции соотнесены с последовательностью дрожжей. 
РНК произвольно разделена на два домена. 
Знак - указывает на пропущенные в данной таблице участки. 
Расшифровка обозначений сайтов и участков дана в тексте записи.  
Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988

		



Ссылки: