Биология и медицина

Таб.09 spl Элайнмент структур U2 мяРНК

Stem/Loop I                         SS Region        psi-1     IIa   psi-2

***************************************************************************

*           10          20      *   30        40         50         60    *

*ACGAAUC UCU.UUGCC UUUU GGCUUAGA*UCA.AGUGUAGUAUCUGUUCU UUUCAG UGUAACAA
CUG*S.c. 
*AUCG.CU UCU.CGGCC UUUU GGCUAAGA*UCA.AGUGUAGUAUCUGUUCU UAUCAG UUUAAUAU
CUG*Chick 
*AUCG.CU UCU.CGGCC UUUU GGCUAAGA*UCA.AGUGUAGUAUCUGUUCU UAUCAG UUUAAUAU
CUG*Mouse 
*AUCG.CU UCU.CGGCC UUUU GGCUAAGA*UCA.AGUGUAGUAUCUGUUCU UAUCAG UUUAAUAU
CUG*Human 
*                               *                                         *

*Au...YY UCU.Y.GCY uuuU RGCU.ACA*UCA.AGUguaguAuCUGUUCU U.Ucag ..UAAY..
cuG*Cons 
***************************************************************************
5' концевой домен                     Центральный домен  Часть 1.
 
Приведены выравненные последовательности S.c. (Saccharomyces cerevisiae),
Chicken, Mouse, Human.  
РНК произвольно разделена на три домена 
(3', 5' концевые и центральный домены. 
Последовательности, способные к формированию псевдоузла обозначены как
пси-1 и пси-2. 
Расшифровка обозначений остальных сайтов и участков дана в тексте записи.
(СМ. ДАЛЕЕ) Данные взяты из Guthrie C., Patterson B. 1988

		

Ссылки:
U2