Теломеры: образование de novo
Новые теломерные последоватетьности могут добавляться по месту разрыва с помощью теломеразы [ Flint, ea 1994 , Morin. ea 1991 ], но только при наличии короткого 3'-оверхенга из 2-4 оснований на конце, напоминающем теломерную ДНК [ Lee, ea 1993 ]. Теломераза имеет высокое cродство к одноцепочечным ДНК-праймерам, соответствующим G-богатой теломерной последовательности. Праймеры с многочисленными кластерами G-остатков являются оптимальными субстратами для элонгации теломеразой, потому что они с большой вероятностью содержат сайт инициации теломеры среди нескольких сотен пар оснований на конце хромосомы [ Kramer, ea 1993 ], узнаваемый якорным сайтом теломеразы. Теломераза также будет удлинять 3'-оверхенг, некомплементарный РНК-матрице, если в праймере присутствует последовательность из G-оснований для связывания фермента [ Lee, ea 1993 , Harrington, ea 1991 ].
Образование теломеры de novo - очень точный процесс. Макроядерные теломеры Euplotes crassus , образуемые при развитийно запрограммированной фрагментации хромосом, всегда начинаются с последовательности GGGGTTTT -одной из восьми возможных пермутаций теломерной последовательности в этом организме [ Klobutcher, ea 1981 ]. Подобным же образом новые теломеры Saccharomyces cerevisiae начинаются с точной последовательности [ Kramer, ea 1993 ], хотя даже последовательности, найденные на концах нативных хромосом, вариабельны ( таблица Последовательности теломерной ДНК ). Хотя теломерные последовательности ДНК могут быть найдены в интерстициальных хромосомных сайтах [ Biessmann, ea 1994 ], интеграция теломерной ДНК в геном может индуцировать хромосомные разрывы [ Farr, ea 1991 , Surosky, ea 1985 ]. Образование теломер, индуцированных этим методом, зависит от интеграции теломерного "зерна", хотя оно может находиться более чем за 100 нуклеотидов от нового конца хромосомы [ Hanish, ea 1994 , Kramer, ea 1993 , Murray, ea 1988 ].
В дрожжах последовательность для инициации теломеры не должна быть совершенной копией теломерной последовательности, но в клетках человека такая идентичность необходима [ Hanish, ea 1994 ]. Это строгое требование соответствия последовательностей скорее обусловлено не самой теломеразой, а фактором, связывающимся с последовательностью TRF-фрагмента теломеры [ Hanish, ea 1994 , Zhong ea 1992 ].