Ретровирусная РНК
Вирусная РНК:
- содержит так называемые короткие концевые повторы , STR , short terminal repeats,
- кодирует три длинных полипептида: полипептид GAG , объединенный полипептид GAG - POL и полипептид ENV , которые cлужат предшественниками вирусных белков, как капсидных (GAG) и оболочечных (ENV), так и регуляторных (GAG - POL),
- Содержит на 5'-конце характерный для информационных РНК кэп сайт , а на 3'- конце поли-(А) хвост .
- Содержит два сайта сплайсинга - донорный SD и акцепторный SA (помните, что я предельно упрощаю ситуацию, потом мы увидим на примере вируса иммунодефицита более реальную картину со сплайс- сайтами).
- Содержит специальный участок, сигнализирующий, что данная РНК может быть упакована во внутрь вирусных белков, чтобы в результате образовалась вирусная частица, вирион. Это сигнал упаковки y, пси . Обратите внимание на то, как расположен этот сайт: между двумя сплайс - сайтами. Благодаря этому может упаковываться только полноразмерная вирусная РНК, а сплайсированная , в которой y отсутствует, остается неупакованной.
