Обработка экзонуклеазой Bal31
Если необходимо получить большое количество делеций с перекрывающимися концами, клонированный ген рестрицируют и подвергают действию экзонуклеазы Bal31. Через определенные промежутки времени отбирают пробы и останавливают реакцию, в результате которой оба конца линеаризованной плазмиды деградируют, причем величина бреши зависит от времени обработки экзонуклеазой. Плазмиды с брешью сшивают с помощью линкерных последовательностей, а расположение концов делеций определяют путем секвенирования ( Johnston, Davis, 1984 ).