Табл 1 во Получение EST
Два принципиальных подхода к получению EST.
________________________________________________________________
кДНК | гякДНК
|
_____________________________|_________________________________|
ПРЕИМУЩЕСТВА |
_______________________________________________________________ |
экспрессирующиеся (транскри- | экспрессирующиеся (транскри- |
бируемые и транслируемые) | бируемые) последовательности |
последовательности генома | генома |
______________________________|_________________________________|
последовательность совпадает | последовательность совпадает с |
с мРНК, облегчая | последовательностью геномной ДНК|
дентификацию | облегчая анализ с помощью PCR |
генов | |
|
| содержит вариабельные участки, |
| отличающие гены одного семейства|
______________________________|_________________________________|
НЕДОСТАТКИ |
_______________________________________________________________ |
последовательность кДНК не | тканеспецефичность экспрессии |
совпадает с последователь- | |
ностью геномной ДНК | |
______________________________|_________________________________|
тканеспецифичность экспрес- | сложность идентификации коди- |
сии и низкое (<30%) | рующих последовательностей |
разнообразие в любом типе | |
клеток | |
______________________________|_________________________________|
относительно высокая консер- | |
вативность, что приводит к | |
сложности дифференциации | |
различных представителей | |
одного семейства генов или | |
генов и псевдогенов | |
Ссылки:
