Хроматин открытый
Мы в точности не знаем, что такое открытый хроматин. Например цитологически он выглядит менее компактным, деконденсированным. Локализуется ближе к центру интерфазного ядра и реплицируется рано в клеточном цикле. Гистоны в нем гиперацетилированы и CpG островки неметилированы. При расщеплении эндонуклеазами, в частности ДНКазойI, открытый хроматин расщепляется в определенных участках на пару порядков быстрее, чем обычный хроматин. Такие быстро расщепляющиеся участки называют " сайтами гиперчувствительными к ДНКазе I ". Кроме того, в открытом хроматине протяженные участки также расщепляются эндонуклеазами с повышенной (раз в 10) по сравнению со средней скоростью расщепления хроматина. Закрытый хроматин проявляет прямо противоположные свойства. Мы не знаем, какие различия между открытым и закрытым хроматинами реально важны для регуляции экспрессии генов. К сожалению, изучено пока очень мало систем, чтобы можно было сделать более определенные выводы.
Исследователи сейчас ищут в дополнение к промоторам и энхансерам, о которых речь шла выше, те последовательности ДНК, которые могут модулировать формирование, изменения и поддерживание хроматиновых структур. Что это за последовательности? Возможно к ним относятся:
Участки начала репликации хромосом.
Участки, определяющие компартментализацию данного локуса в ядре.
Участки ,определяющие формирование высших структур хроматина.
Участки, определяющие границы между открытым и закрытым хроматинами.
