Транскрипционная пауза: роль структуры хроматина
Важным фактором, влияющим на прохождение промотор-проксимальной паузы, является структура хроматина в районе промотора. В системе in vitro показано, что образование нуклеосом более чем в 100 раз увеличивает продолжительность транскрипционной паузы по сравнению с таковым in vivo и только одновременное добавление к системе и активатора ( HSF ), и hSWJ/SNF-фактора , разрушающего нуклеосомы [ Kwon ea 1994 ], значительно уменьшало ингибиторный эффект нуклеосом на элонгацию транскрипции и ускоряло прохождение промотор-проксимальной паузы [ Brown ea 1996 ]. Действительно, показано, что in vivo активация hsp70 гена сопровождается разрушением нуклеосомной структуры в транскрибируемом районе в пределах 400 пн перед РНК-полимеразой [ Brown ea 1997 ] и высоким уровнем GAF-белка по всей транскрипционной единице, распределение которого совпадает с таковым для РНК-полимеразы II [ O'Brien ea 1995 , O'Brien ea 1993 ]. Это указывает на то, что для поддержания хроматина в открытой конфигурации необходим высокий уровень GAF-белка . Тот факт, что этот процесс идет с утилизацией АТФ [ Tsukiyama ea 1994 ] свидетельствует о том, что, либо сам GAF связывает и использует АТФ, либо в этом процессе он кооперируется с другими белками, в частности с NURF , CHRAC или ACR [ Tsukiyama ea 1995 , Varga-Weisz ea 1997 , Ito ea 1997 , Martinez-Balbas ea 1998 ]. Эти нуклеосом-ремодулирующне факторы, обнаруженные у Drosophila, состоят из нескольких субъединиц, одна из которых является ISWI-АТФазой [ Varga-Weisz ea 1997 , Ito ea 1997 , Martinez-Balbas ea 1998 ], которая, как полагают, играет ключевую роль в хроматин- ремодулирующих реакциях [ Varga-Weisz ea 1997 ], активируя такие факторы, как GAF [ Tsukiyama ea 1995 , Okada ea 1998 ].
