Альфоидная ДНК: мономеры
Мономер альфоидной ДНК - элементарная, то есть внутренне не повторяющееся, единица альфа-сателлитной ДНК длиной около 171 н. п. Обычно соседние мономеры ориентированы по типу "голова к хвосту" [ рис. 1 каз ]. Гомология между последовательностями индивидуальных мономеров и усредненной ( консенсусной) последовательностью всех известных альфа-сателлитных мономеров составляет обычно 60-70%.
Предковые мономерные типы не в одинаковой степени гомологичны друг другу. Их можно разделить на две группы:
тип А : J1 , D2 , W4 , W5 , M1 , R2
тип В : J2 , D1 , W1 , W2 , W3 , R1 В работе Romanova et al. (1996) показано, что из семи различий между консенсусными последовательностями типов А и В, пять расположены в участке длиной 16 нуклеотидов, представляющем собой сайт связывания белка pJ? [ Gaff et al., 1994 ] (тип А) или сайт связывания белка СЕNР-В (тип В).
