Ассоциация strA-strB генов с транспозонами
Значительный вклад в процесс распространения генов устойчивости к стрептомицину strA-strB среди современных штаммов бактерий вносят транспозоны, родственные Tn5393 , причем эти транспозоны, как правило, находятся на плазмидах среднего размера [ L'Abee-Lund, 2000 ]. Было сделано предположение, что транспозоны такого типа могут присутствовать и в исследуемых современных и древних природных штаммах и проведено исследование этого предположения.
Для выявления транспозонов были использованы два различных метода:
- мобилизация стрептомициновых детерминант с использованием в качестве мишени конъюгативных плазмид широкого круга хозяев [ Mindlin, 2001 , Mindlin, 2005 ] и
- выявление генов транспозиционного модуля, гомологичных таковым Tn5393, с помощью специфических зондов с последующим определением их сцепления с стрептомициновыми детерминантами.
Из табл. 1 видно, что активные транспозоны выделены из одного современного (I-35) и двух древних (MR29-12 и Tik-3) штаммов. Анализ структуры первого из них показал полное совпадение его рестрикционной карты с картой Tn5393c (AF262622) ( рис. 1 ). В дальнейших опытах этот транспозон использовался в качестве контроля.
На рис. 1 представлена схема организации трех, наиболее распространенных в популяциях современных бактерий-паразитов животных, растений и человека, вариантов транспозона Tn5393 , отличающихся между собой наличием IS-элементов ( IS1133 и IS6100 ) - Tn5393 , Tn5393b и Tn5393c [ Mantengoli, 2005 ]. Были выявлены гены транспозиционного модуля, гомологичные генам Tn5393, и установлено их сцепление с генами устойчивости к стрептомицину strA- strB ( рис. 2 ). При этом не было обнаружено ни одного устойчивого к стрептомицину штамма, содержащего IS1133 (характерного для Tn5393 ) и IS6100 , являющегося специфическим маркером Tn5393b . В противном случае размер фрагмента на рис. 2 ,б составлял бы более 2 тпн.
Таким образом установлена принадлежность всех исследованных стрептомициновых транспозонов к типу Tn5393с , наиболее простому по своей структурной организации и, по-видимому, возникшему ранее остальных.
