Рис. 1(petr). Организация Tn5393 и родственных ему транспозонов
Структурная организация Tn5393 и родственных ему транспозонов.
Условные обозначения: прямоугольниками обозначены гены, а черными стрелками - инвертированные повторы.
Гены tnpA и tnpR кодируют ферменты транспозазу и резольвазу соответственно. Гены strA и strB кодируют фосфотрансферазы, обуславливающие устойчивость к стрептомицину.
Указаны места инсерций IS1133 в Tn5393 и IS6100 в Tn5393b.
Маленькими стрелками указаны места отжига использованных праймеров. Первая пара праймеров (1F: GATGTGTTCCCATCCG и 1R: ACGTTATCTTGGCGGAAGGG) предназначена для поиска гена tnpA из Tn5393, и при использовании ее для проведения ПЦР образуется продукт размером 1046 нп (с 70 по 1115 нуклеотид последовательности M96392). Вторая пара праймеров (2F: GTGTCGAACGGGACAATATC и 2R: GAGCCAAAAGATCGAGCTGC; с 3127 по 5433 нуклеотид последовательности M96392) дает возможность подтвердить сцепление генов strAB с транспозиционным модулем типа Tn5393, а также проверить наличие инсерции IS1133, аналогичной имеющейся у Tn5393 (при наличии IS1133 ПЦР-продукт должен иметь размер 2307 нп, а в его отсутствии - 1075 нп).
